导出数据
简介
数据导出页面您可在研究开始页面中点击数据导出图标:
数据导出页面可供您导出或预览数据:
- 预览 - 使用预览,您能直接在屏幕上直接查看数据以及不同图表类型。您也可直接查看eCRF页面。
- 导出 - 您可导出数据做进一步的分析或存档。Viedoc提供以下数据导出格式:
- Excel
- CSV
- SAS
- CDISC ODM
筛选数据用于预览/导出
您可筛选您想要预览/导出的数据,请见如下部分。
对国家和中心筛选
若您有多个中心的权限,您可筛选特定的国家或中心。
当您筛选特定国家的时候,只需点击国家的名字。选中国家的中心会以蓝色字体显示在数据导出页:
对于特定国家,您可对数据导出做以下选择:
- 所有中心(默认)
- 您所选择的特定中心。选中中心标为蓝色字体。
请注意!每次只能选中一家中心。
若您想要撤销选中中心,则点击所有中心。
若您想要撤销选中国家,点击该国家旁的(X)标记。
当您筛选国家或中心,包含受试者旁的括号中的受试者数也会相应更新。
包含受试者
您可选中所有受试者或特定受试者来预览或导出数据。
选择包含受试者步骤:
1 | 选择单个受试者。 |
2 |
点击受试者边的“+”图标添加您相应的受试者: 重复这个步骤,您可添加你想要导出/预览数据的受试者。 |
若您想撤销特定受试者的选定,点击受试者边的“-”图标或受试者ID边的“x”:
访视和时段
您可选择所有访视或特定的访视。您也可筛选数据编辑或添加在特定时段内。
请注意!所有可选访视是基于您选择的第一个中心的最新版本的设计。若有多个版本设计在几个选中的中心中,请您分次选中相应中心的访视。
选择访视
您可选择:
- 所有访视(默认)
- 单次访视。详见下方指导。
选择访视的步骤:
1 | 选中单次访视。 |
2 |
点击访视边的“+”的图标并在下拉菜单中选择访视。选中的访视会出现的访视和时段: |
若您想撤销选中的特定访视,请点击“-”图标或者访视旁的“x”:
选择一个时段
若您想选择特定的时段:
1 | 点击时段: |
2 | 您可按照以下选择:
|
3 | 您可选择定义至某个日期,从某个日期或在此时段内。 |
4 | 选择日期。 |
提示!筛选从某个时间点开始后编辑或添加的数据对于监查员比较有用,这样您可以选择比如您上次中心监查之后录入或修改的数据。
若您想撤销选中的时段,请点击时段边的“X”:
表和项
您可选择哪些表单和项需要包括进数据导出中:
- 所有表和项(默认)
- 单个表和项 - 请见下方步骤。
请注意!当表单和数据点依旧存在于最新设计中,且最新设计已经应用于第一个选中的中心时,才可被导出。同时,请注意用户所能选择的表单和数据点取决于该用户的可见权限。
选择特定的表单:
1 | 选中单个表和项。 |
2 | 选择您想要包括的表单:
|
若您想撤销选中特定的表单,点击表单旁的“X”:
数据类型
通过审核状态筛选
您可对导出数据做审核状态的筛选:
- 已签名数据(默认选中) - 数据已经(由研究者)在Viedoc Clinic中签名。若您想了解关于签名的信息,请查看电子签名。
- 未签名数据(默认选中) - 未签名数据。
- 已SDV或无需SDV的数据(默认选中) -数据已经(由监查员)在Viedoc Clinic中SDV或者无需做SDV的数据。
- 需要SDV的数据(默认选中) - 数据在Viedoc中需要做SDV但还未做SDV。
更多信息
您可选择更多的信息在导出的数据集中,但这取决于导出格式。
质疑和质疑历史
当您点击质疑后,您也可选择是否要包括质疑历史。
质疑可有以下导出格式:
- Microsoft Excel - Office Open XML
- CSV - Comma-separated values
- CDISC ODM - XML - 若您选择ODM,无论您是否选择质疑历史,当你点击ODM后,该选项会消失。
详见:
审核状态
审核状态可有以下导出格式:
- Microsoft Excel - Office Open XML
请注意!当您在布局中选择每个值占一行,则审核状态无法导出。 - CSV - Comma-separated values
请注意!当您在布局中选择每个值占一行,则审核状态无法导出。 - PDF - PDF存档 - 只包括签字相关信息(无SDV,锁定状态,或监察员审查状态)
- CDISC ODM - XML
详见:
访视日期
访视日期可有以下导出格式:
- Microsoft Excel - Office Open XML
- CSV - Comma-separated values
- CDISC ODM - XML
当你选择Excel导出文件包括访视日期时,您将能看到一个单独的访视日期的表格,其中包括以下信息:
表格列名 | 描述信息 |
---|---|
Site sequence number | 研究中心的序列号。 |
Site name | 在Viedoc Admin中设置的中心名称。 |
Site code | 在Viedoc Admin中设置的中心代码。 |
Subject sequence number | 受试者在中心的序列号。 |
Subject Id | 受试者ID,该格式在Viedoc Designer中定义。受试者ID在 Viedoc Clinic中的受试者卡,受试者详情页等会显示。 |
Event Id | 访视ID,在研究设计中设置(Viedoc Designer中)。 |
Event name | 访视名,在研究设计中设置(Viedoc Designer中)后会显示在Viedoc Clinic。 |
Event repeat key | 对于重复访视,这是用于区分同一访视的不同的重复次数(在Event ID中可查看到)。该列在Viedoc 4.39和之后版本可显示。 |
Event status | 访视状态。可由以下状态:
|
Event date | 访视日期,在Viedoc Clinic中填写的访视开启日期。 |
Planned date | 访视计划日期,在Viedoc Clinic中如有设置访视计划日期。 |
Proposed date | 建议访视日期,如设置在Viedoc Designer中。 |
Window start date | 建议窗口期(建议访视日期前X日),如设置在Viedoc Designer中。 |
Window end date | 建议窗口期(建议访视日期后X日),如设置在Viedoc Designer中。 |
Initiated by | 访视开启人用户名和ID。 |
Initiated date (UTC) | 访视开启日期和时间(UTC)。 |
Last edited by | 最后一次编辑访视的用户名和ID。 |
Last edited date (UTC) | 最后一次编辑访视的日期和时间(UTC)。 |
Design version | 该访视的设计版本。 |
已上传文件
当您选中已上传文件的选项后,则已上传文件和缩略图(如有)都会成为Excel,CSV和PDF的导出文件的一部分:
- Excel - 数据导出文件本身(.xls)和相应的已上传文件都会在一个压缩包中。
- CSV, PDF - 所有已上传文件都会在一个导出的压缩包中。
- 当你选中包含历史(当您选了每个值占一行后),当前已上传文档和之前一样会包括在文件夹中,另一个子文件夹(命名为编辑序号)为之前的文件版本。
导出(Excel, PDF, CSV, ODM)和预览都可查看已上传文件的以下信息:
- 文件名
- 文件大小(bytes)File Size (in bytes)
- 文件Hash
- 文件在压缩文件中的路径。
下列信息将存在全部历史信息中:
- 谁上传了文件
- 上传的文件
- 首次/更新 (第一次上传/更新已上传文件)
- 文件名File Name
- 文件大小(bytes)
- 文件Hash (MD5)
- 文件链接
未完成表单
未完成的表单可以导出为以下导出输出格式:
在已开启访视中未开启的表单,将其视为未完成表单。这适用于所有类型的访视,包括受试者引发的访视。对于可重复表单,如果未开启该表单的第一个实例,则该表单被视为未完成。重置表单会导致该表单处于未完成状态。
当选择要包括在Excel导出中是,单独的Pending forms会包括以下信息:
列名 | 描述 |
---|---|
Site sequence number | 研究中心的序列号。 |
Site name | 在Viedoc Admin中设置的中心名称。 |
Site code | 在Viedoc Admin中设置的中心代码。 |
Subject sequence number | 受试者在中心的序列号。 |
Subject Id | 受试者ID,该格式在Viedoc Designer中定义。受试者ID在 Viedoc Clinic中的受试者卡,受试者详情页等会显示。 |
Event sequence number | 该受试者同一访视的重复次数。 |
Event Id | 访视ID,在研究设计中设置(Viedoc Designer中)。 |
Event name | 访视名,在研究设计中设置(Viedoc Designer中)后会显示在Viedoc Clinic。 |
Event repeat key | 对于重复访视,这是用于区分同一访视的不同的重复次数(在Event ID中可查看到)。该列在Viedoc 4.39和之后版本可显示。 |
Activity Id | 活动ID,在Viedoc Designer中设定的活动ID。 |
Activity name | 活动名,在Viedoc Designer中设定的活动名。 |
Form Id | 表单ID,在Viedoc Designer中设定的表单ID。 |
Form name | 表单名,在Viedoc Designer中设定的表单名。 |
Event date | 访视日期,在Viedoc Clinic中填写的访视开启日期。 |
Pending since |
表单从什么时候开始需要录入。 这并不是总是启动访视的日期。对于由于可见条件而被隐藏的表单,这个日期可以是表单被触发且可录入时。 |
医学编码
医学编码可以按以下格式导出:
- Microsoft Excel - Office Open XML。详情请见Excel导出中的医学编码。
- CSV - Comma-separated values - 和Excel相类似,请参考Excel导出。
- CDISC ODM - XML。详情请见ODM导出中的医学编码。
编辑状态
编辑状态可以按以下格式导出:
- Microsoft Excel - Office Open XML
- CSV - Comma-separated values
- PDF - PDF Archive
- CDISC ODM - XML
导出格式
导出数据格式可在导出格式>导出至:做选择:
您可导出以下格式:
1. Microsoft Excel - Office Open XML
2. CSV - Comma-separated values
3. PDF - PDF Archive
4. CDISC ODM - XML
Microsoft Excel / CSV
Viedoc用户可使用 Microsoft Excel Open XML格式,请使用Excel 2007及以后的版本。
若您想了解更多信息,请查看Excel导出。
CSV
CSV的导出文件和Excel相类似。CSV导出的文件是一个压缩文件包包括相应的Excel表。若您欲了解更多信息也可查看Excel导出。
CSV导出时,当您选择了每个活动占一行,则您可继续选择是否要添加包含相关SAS指令。详情请见导出SAS。
若您想了解更多关于PDF导出的信息,请见PDF导出。
CDISC ODM
Operational Data Model (ODM)是不基于任何平台或系统的交互和存档临床试验数据的格式。该格式包括了临床数据以及其相关的元数据,管理数据,参考值数据和稽查信息。所有需要在不同软件中需要分享的信息包括设置,运行,分析,递交或长期保存信息都在这个模型中。
该类型数据导出可用于CDISC ODM文件,而无论是否需要Viedoc的扩展。若您想选择包括Viedoc的扩展,只需勾选包含扩展。 Viedoc的扩展是Viedoc特定的设置在CDISC标准中无法展示。若您今后想再将数据导入Viedoc中,则请您勾选该选项。
ODM导出文件包括以下:
Study
标签包括研究设置,研究设计和试验流程。AdminData
包括用户和中心的设定。ClinicalData
标签包括Viedoc Clinic中录入的数据。Association
标签包括SDV,质疑,医学编码,临床审核,数据审核等信息。
详见:
数据导出的Viedoc版本
您可在导出数据的时候选择Viedoc的版本。该选项可以让您导出和之前Viedoc版本一样格式的文件。
请注意!该功能在Viedoc Admin中可选。若您无法查看到,则可能是因为未被激活。
若该选项在Viedoc Admin中激活,您可在导出格式下方看到导出版本下拉菜单。若您想导出最新Viedoc版本的数据,请选择Viedoc最新版本:
可供导出的Viedoc版本也会在最新的导出文件区域导出。
导出的文件会存有关于Viedoc版本的信息。您可在以下文件中找到:
- Excel,请查看README 的部分。
- CSV,请查看README 的部分。
- PDF,每张PDF页脚或右侧会有显示。
- ODM,Viedoc版本将显示在导出版本SourceSystemVersion中。
导出版本
Viedoc导出版本中,并不是每一个版本都会显示,只有那些版本会影响数据结构的版本会在下拉菜单中。
新的4.68的Viedoc发布后,如下导出版本可选择:
导出版本 | 结构上的改变 |
---|---|
Viedoc最新版本 | 当您选择Viedoc最新版本,导出的数据格式会自动和最新结构相匹配。 |
Viedoc 4.68 | 添加了PDF存档导出系统检查,将存档拆分为每位受试者一个PDF文件,并将生成的PDF存储在zip文件中。 |
Viedoc 4.67 | 为核准医学编码引入两个新栏目:“核准人”和“核准日期”。 |
Viedoc 4.51 | 添加了三个新的form repeat keys,还有在PDF的导出中添加了TOC(tables of contents),请在如下表格中查看信息。 |
Viedoc 4.39 | 添加了可重复表单和可重复访视,请在如下表格中查看信息。 |
Viedoc 4.38 | 最初导出格式(Viedoc4.38或以前)。 |
在Viedoc 4.51中,您将能看到如下变化:
文件格式 | 结构上的变化 |
---|---|
Excel | 您将能在导出中看到三列新内容:Subject form sequence number (SubjectFormSeq),Origin Subject form sequence number (OriginSubjectFormSeq)和Source Subject form sequence number (SourceSubjectFormSeq)。此三列依次排列在Form Sequence Number (FormSeq)列旁。 |
ODM | 新版本的三张新的表格将会保留在ODM中: v4:SubjectFormSeqNo ,v4:OriginSubjectFormSeqNo 和v4:SourceSubjectFormSeqNo ,在FormData 中,在FormRepeatKey 后。 |
从PDF的第二页开始,您将能看到目录页。 |
在Viedoc 4.39中,您将能看到如下变化:
文件格式 | 结构上的改变 |
---|---|
Excel | 添加了一列Form sequence number (FormSeq)而这一列包括了FormRepeatKey的信息。 |
ODM | FormRepeatKey 现在也包括了活动ID,按照如下格式: FormRepeatKey$ActivityId ,导出版本的属性信息ExportVersion 也添加到了ODM中。 |
格式概述将用来展示访视和表单名。 |
预览数据
预览数据的图标只有当您选择Excel或者CSV 时,才会显示。
当您选择每个值占一行时,该图标也不会出现。
筛选您相要预览的数据,详见筛选数据用于导出/预览。
数据表格
在数据表格中,您可以表格形式浏览:
1. 如果选择了数据按表单归组,则可以选择要显示其数据的表单。
2. 用筛选框可以预览包含筛选文本所有的字段。
3. 可以在紧凑试图和宽松视图间切换。
4. 单击列标题以按升序对数据进行排序。再次单击则按降序排列。第三次单击则取消列的排序。要重新排列表中列的顺序,只需点击列标题并横向拖拽。
5. 点击打开列菜单,更多信息请查看列菜单。
6. 点击打开列筛选,更多信息请查看列筛选。
7. 单击表中任何的超链接,可以以只读模式查看表单。
8. 选择交叉检查模式,可以让您在两个表之间交叉检查。两个表之间的选择,筛选以及排序都是相互独立的。
列菜单
列菜单包含:
|
|
|
|
|
更多信息请查看下面的子目录。
列展示选项
靠左/靠右固定可使侧面滚动时在最左侧或最右侧保持可见的列。 选择无钉选以取消固定列。
自动调整所有列将列宽调整为列中文本的宽度。
重置列会将列的固定,调整大小和顺序重置为初始状态。
列筛选
使用筛选来缩小预览数据的选择范围。
1. 根据每列中的字段的类型,您可以做以下的筛选:
- 按文字筛选:
- 包括
- 不包括
- 等于
- 不等于
- 从...开始
- 以...结束
单选,下拉,复选日期或日期/时间的表单被视为文本。
请注意!使用文字筛选时请注意大小写。
- 按数值筛选:
- 等于
- 不等于
- 小于
- 小于或等于
- 大于
- 大于或等于
- 在范围内
2. 一旦指定了筛选,您可加一个筛选,用和或或。
3. 基于列中可用数据的预定义筛选选项。
列选择选项
选择要在预览表中显示的列。
使用搜索字段搜索列。
默认情况下,系统数据从表中排除。 要包括系统数据,请从系统数据类别中选择要包括的列。 请注意,某些系统数据列仅在您为每个活动占一行时才可用。
更多信息请查看Excel导出。
数据表内容菜单
右键单击数据表中的单元格时,将显示内容菜单:
复制:将单元格值复制到剪贴板。
复制含标题:将单元格值及其列标题复制到剪贴板。
Excel导出:导出数据选项卡上的预览数据。 生成的Excel文件将具有与预览相同的数据排序和筛选以及列顺序。
饼图
选择您需要做饼图的数据并点击绘制:
若您选择了数据按表单归组,那您只能选择您在数据表格中选择的表单的数据组。
点击数据点可查看其详情。
柱状图
选择您想要绘制柱状图的X轴和Y轴,然后点击绘制:
若您选择了数据按表单归组,那您只能选择您在数据表格中选择的表单的数据组。
点击数据点可查看其详情。
折线图
选择您想要绘制折现图的X轴和Y轴,然后点击绘制:
若您选择了数据按表单归组,那您只能选择您在数据表格中选择的表单的数据组。
数据导出模板
当您对导出数据时做了一些设定,您可将这些设定保存为一个模板。然后你和其他用户选择性地可使用这些设置做数据导出。
保存设定成一个新的导出模板
若您需要保存设定成一个新的导出模板:
- 点击保存设定成一个新的导出模板。
- 在弹出对话框中输入模板的名字并选择是否要设定为个人还是共享模板。若您选择了共享,您将需要选择哪些角色可使用这个模板。下拉菜单中将会有当前有效版本中有导出数据权限的角色。
- 点击保存修改。导出模板列表的最上一行将会显示您刚保存的模板。
应用一个数据导出模板
若您需要应用一个数据导出模板:
- 点击在数据导出区域中导出模板下的查看所有模板。
- 在您想要使用的模板胖点击应用图标。
- 点击导出数据就可在导出时应用您所选择的模板。
提示!您也可快捷操作只需点击导出模板区域旁的模板的应用。
编辑数据导出模板
若您需要编辑数据导出模板:
- 点击在数据导出区域中导出模板下的查看所有模板。
- 导出模板列表显示在页面上。点击您想要编辑模板旁的编辑图标。
- 在弹出对话框中,您可编辑导出模板的名字以及共享/个人的设定。
请注意!您只可编辑您自己创建的模板。
删除一个数据导出模板
若您需要删除一个数据导出模板:
- 点击在数据导出区域中导出模板下的查看所有模板。
- 导出模板列表显示在页面上。点击您想要删除模板旁的删除图标。
- 在弹出框中点击删除。
请注意!您只可删除您自己创建的模板。
导出数据
若您想要导出数据:
1 | 筛选想要导出的数据。请见筛选数据用于导出。 |
2 | 选择导出格式。 |
3 | 可选择数据导出的Viedoc版本。 |
4 | 可选择导出数据的预览。 |
5 |
点击导出数据。导出的状态将在右侧的的最新的导出文件部分显示。当导出完成后,您可下载文件: 导出文件可存于本地。文件名的命名规则为:申办方代码_国家编码_中心编号_日期_时间:
请注意! 如果文件名申办方代码或中心编号中有任何字符在Windows中是无效的,则这些字符会自动代替为“-”。 |
最新的导出文件
您可在最新的导出文件中,您可下载或删除记录。
请注意!该列表是根据用户的导出来排列的,比如说你只能看到你自己导出的数据。
最新的五个导出将显示在列表中。若您想要更多的导出,请点击下方查看所有导出文件。
每条都将提供以下信息:
1. 导出的日期和时间。
2. 导出文件的状态:
- 等待中 - 等待导出的状态。
- 正在进行 - 正在进行导出的过程中。
- 完成 - 已成功导出并可进行下载。
- 错误 - 导出过程中出现错误。
3. Viedoc导出版本 - 请见数据导出版本。
4. 导出的受试者数。
5. 导出文件的格式。
6. 导出格式的布局(如适用)。
7.文件大小。
注意!如果在导出后已遮盖数据,则无法下载该导出,因为其中可能包含后来被遮盖的数据。